تنقسم مجموعات مكتبة جامعة الفلاح إلى سبع مجموعات هي:
الكتب الدراسية تشمل هذه المجموعة الكتب المنهجية المقررة جميعها للمساقات الدراسة كافة في الجامعة .
الكتب العامة تشمل هذه المجموعة الكتب المساندة للمقررات الدراسية ، والكتب الثقافية والعلمية ذات الموضوعات المختلفة ، التي يمكن للمستفيدين استعارتها .
المراجع تشمل المراجع الأساسية مثل : القواميس والموسوعات والأدلة والكتيبات والبيانات الببليوغرافية والحوليات إلخ ، التي تستخدم فقط داخل المكتبة و لاتعار.
الوسائط المتعددة تحتوي هذه المجموعة على المواد السمعبصرية التي تستخدم فقط داخل المكتبة و لاتعار .
الرسائل الجامعية تشمل هذه المجموعة رسائل الماجستير و الدكتوراة ، و تستخدم فقط داخل المكتبة و لاتعار.
الدوريات تتكون الدوريات بالمكتبة من مجلات علمية محكمة وغير محكمة، والصحف المحلية والدولية المطبوعة وإلإكترونية. التي تستخدم داخل المكتبة و لاتعار .
قواعد البيانات الإلكتروتية توفر مكتبة الجامعة اشتراكاً في مجموعة مميزة من قواعد البيانات العالمية ، وتتيح استخدمها لرواد المكتبة من داخل الحرم الجامعي و خارجه .